《灵剑尊》是由索以文化制作的3D动画。根据同名小说《灵剑尊》和漫画《灵剑尊》改编。该动画讲述了落魄少年楚行云立志要改变现状奋发图强创造一片新天地的故事大梦一场，落魄少年立志要改变现状奋发图强创造一片新天地。珍奇异宝，功法武决，遗失的强者洞府，在这个天才辈出，充满挑战和机缘的时代，且看落魄少主如何闯荡大陆、遭奇遇，成为叱咤风云的至尊天帝。以前的仇人，现在，绝不会放过！梦中的遗憾，现在，一定要弥补！待到灵剑长啸之时，天地三界，我为至尊！
在暑假最后一天，为挽救暑假作业，阿良良木历和忍野忍借助积聚在北白蛇神社的怪异之力试图回到一天前，但是却阴差阳错地回到了11年前的母亲节前日。历所幸在母亲节那天挽救了本应死去的八九寺真宵，并把迷路的真宵带到了母亲的家。然而，当历和小忍回到原本的时间点却发现——此时全世界的人类都成为了僵尸。事实上，无论是历和小忍回溯到的11年前，还是从11年前返回的世界，都是平行于原本世界的异世界。在这个异世界中，由于八九寺真宵没有死，也就没有幽灵真宵发现从「叡考塾」废墟出走的小忍的事（6月14日），小忍也就没有找到历，更没有机会躲进历的影子里，最后历被黑羽川杀死。历死后的小忍取回了全盛时的力量，恢复为姬丝秀忒·雅赛劳拉莉昂·刃下心。姬丝秀忒想要把全世界的人都变成她的眷属吸血鬼，然后毁灭世界。但是400年才造出两个眷属的姬丝秀忒没能成功制造出大量眷属，而是制造出处于完全暴走状态的僵尸。姬丝秀忒仅用了五天就毁灭的世界（实际上仍有少部分人幸存）。只要杀死姬丝秀忒僵尸化的人类就可以变回人类，为此影缝余弦和贝木泥舟还联手攻击姬丝秀忒，但遭全灭。看到人类灭亡之后的姬丝秀忒，选择纵身到太阳底下，但却自杀失败。当姬丝秀忒看到异世界的自己和历如此亲近时，喜极而泣，最后牺牲自己助小忍和历回到原本的世界——小忍通过吸取姬丝秀忒的血液获取了穿越时空的灵力。
若干年前，号称城市三大高手之一的龙泽所率领的团队败给了利用阴谋取胜的泰坦。今天，为了能够打败不可一世的泰坦，龙泽的孩子龙然龙襄姐弟踏上了集合伙伴的征程。两人寻找当年的前辈和现在的强者，克服各种困难请他们回归和进入。之后，在战国博士的强力训练下，龙然与伙伴们得到了巨大的提升。与兽神队战斗并成为战友，最后，在与泰坦的战斗中，历经各种困难考验，取得最终的胜利。
看似在过去的心理阴影及独自的别扭思考回路之下讴歌着“独自生活”的比企谷八幡，偶然地被生活指导担当教师平冢静带着加入了「侍奉部」。他和同社团所属的令人窒息的完美美少女·雪之下雪乃，以及班级上位阶级所属的时髦女子·由比滨结衣一同，从解决班上的人际关系问题到给学生会帮忙，度过着解决各种事件的每一天。 季节流转，时至春天。八幡与结衣，接受了雪乃最后的委托。在准备3月的毕业典礼过程中，还被彩羽请求协助毕业舞会…——追求真物的八幡，与3人的关系逐渐改变。究竟他的高中生活将迎来怎样的结局！？
